Dear Justin<br><br>I read your articles about PRODRG server,they were very useful.<br>But I have a question:<br>are charges of functional groups and generally other atom groups the same in all force fields?<br>Because you have modified charges of your molecules by Gromos96 53A6 while prodrg server is generating topology files in 43A1.<br>
I want to know can I replace charges from gromos 53A6 or other forcefields?<br>thanks in advance<br>