<div>Hi,</div>
<div> </div>
<div>I am using tpbconv and mdrun to extend a simulation. I use it with the append option but the files still get overwritten or erased. Can someone help me in this regard?</div>
<div> </div>
<div>Pooja</div>
<div> </div>
<div> </div>
<div>Commands (in python)</div>
<div>cmd = &#39;(%s/tpbconv -extend %f -s rex_%d.tpr -o rex_%d.tpr)&#39; %(GROMPATH,dtstep,i,i)<br>      os.system(cmd)<br>      time.sleep(1)<br>      cmd  = &#39;nbs submit -command &quot;&#39;<br>      cmd += &#39;(%s/mdrun_mpi -noh -noversion -s rex_%d.tpr -e rex_%d -c after_rex_%d -cpi restart%d -cpo restart%d -append -g rexlog%d -x rextraj%d &gt;/dev/null); &#39; %(GROMPATH,i,i,i,i,i,i,i)<br>

      cmd += &#39;&quot; &#39;<br>      cmd += &#39;-nproc 1 &#39;<br>      cmd += &#39;-name &quot;GENHAM-DIHEDRAL-%d&quot; &#39;%(i)<br>      cmd += &#39;-mail start end &#39;<br>      cmd += &#39;-elapsed_limit 16h &gt;&gt; rexid&#39;<br>

      os.system(cmd)</div>
<div><br clear="all"><br>-- <br>Quaerendo Invenietis-Seek and you shall discover.<br></div>