Dear all<br><br>I would like to do coarse-grained simulations using reduced LJ units. As I can see in the manual, this is possible, but I don&#39;t understand how...<br><br>I use the Gromos96 53a6 force field. <br><br>In the <b>ffG53a6nb.itp </b>the<b> ó</b> and <b>å</b> are in <b>(nm</b>) and <b>(KJ/mol</b>)<br>
Also in the <b>ffG53a6.atp</b> the <b>mas</b>s is in<b> gr/mol</b>. Finally in the <b>mdp</b> file the <b>ref_t</b> is in <b>(K)</b> and the <b>time_step</b> in <b>(ps)</b><br><br>If I creat an atom A, and define <b>å=ó=m=1</b>, how can I define that I want these numbers to be in reduced units?<br>
<br>Also, how can I have reduced units in my <b>.mdp </b>file?<br><br>Kind Regards, Chrysostomos<br>