Hi,<br><br>I want to run NVT equilibration for a protein molecule and want to increase temperature gradually i.e.<br>from 0 to 300 K over a 20 ps, but i have some doubts regarding this:<br><br>1)Whether I should read velocities from previous steps of NVT during gradual heating or every time i have to generate velocities for the new temperature.<br>
2)Whether the 20ps time is appropriate for this purpose.<br clear="all"><br>-- <br><font color="#3333ff"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif"><div>---------------------------------<br>Thanks and regards<br></div><div>
<span style="font-family: arial; font-style: normal;"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">Bipin Singh</font></i></span></div></font></i></font><div><font color="#3333ff" face="arial, helvetica, sans-serif"><i><br>
</i></font></div><br>