<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:12pt;color:#000000;"><div>Dear All,<br><br><span>I am trying to install gromacs in ubuntu. I configured both fftw and gromacs in my home folder following the instructions on <a target="_blank" href="http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions">http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions</a>. However, when I&nbsp; do "make", I get an error in the end (pasted below). I have also attached the log file of compilation with the email.</span><br><br>/usr/bin/ld: /home/majid/user/soft/fftw/lib/libfftw3f.a(mapflags.o): relocation R_X86_64_32 against `.rodata' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC<br>/home/majid/user/soft/fftw/lib/libfftw3f.a: could not read symbols: Bad value<br>collect2: ld returned 1 exit status<br>make[3]: *** [libmd.la] Error
 1<br>make[3]: Leaving directory `/home/majid/user/down/gromacs/src/mdlib'<br>make[2]: *** [all-recursive] Error 1<br>make[2]: Leaving directory `/home/majid/user/down/gromacs/src'<br>make[1]: *** [all] Error 2<br>make[1]: Leaving directory `/home/majid/user/down/gromacs/src'<br>make: *** [all-recursive] Error 1<br><br>Moreover, I wanted to ask if I can download gromacs in my home directory using the ubuntu software center or synaptic manager?<br><br>Thanks,<br>Majid<br></div>
</div><br>

<hr size=1><a href="http://us.rd.yahoo.com/evt=49938/*http://tools.search.yahoo.com/toolbar/features/mail/">Never miss an email again!<br>Yahoo! Toolbar</a> alerts you the instant new Mail arrives.<a href="
http://us.rd.yahoo.com/evt=49937/*http://tools.search.yahoo.com/toolbar/features/mail/"> Check it out.</a></body></html>