<div>Hello, <br><br>While trying to visualize a MARTINI protein/trajectory in VMD, I came across the script <a href="http://top2psf.pl">top2psf.pl</a>. i attempted to use it as: <br><br>&gt; ./<a href="http://top2psf.pl">top2psf.pl</a> -i martini.top -o martini.psf <br>
this generates the error: <br>&gt; Cannot open atoms for reading: No such file or directory <br><br>Anyone encounter this or have any suggestions for visualizing MARTINI proteins in VMD? Thank you for any help.</div>
<div> </div>
<div>-j</div>