<p>Hi Bipin,</p>
<p>Try using a .gro or .pdb file as reference structure (-s). Only .tpr files are version specific.</p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk</p>
<p><blockquote type="cite">On Feb 21, 2011 8:05 AM, &quot;bipin singh&quot; &lt;<a href="mailto:bipinelmat@gmail.com">bipinelmat@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br><pre>Dear GMX users,<br>I want to calculate the correlated motion between atoms during the md simulation<br>
for that purpose I am using g_covar(the one which is available under <a href="http://www.gromacs.org/Downloads/User_contributions/Other_software" target="_blank">http://www.gromacs.org/Downloads/User_contributions/Other_software</a>)<br>

but it is not compatible with the GROMACS-4.5.3, so please suggest me the alternative way or does anyone have the modified g_covar for <br>GROMKACS-4.5.3.<br><br></pre>-- <br><font color="#3333ff"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif"><div>

---------------------------------<br>Thanks and regards<br></div><div><span style="font-family:arial;font-style:normal"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">Bipin Singh</font></i></span></div></font></i></font><div>

<font color="#3333ff" face="arial, helvetica, sans-serif"><i><br></i></font></div><br>
<br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></p>