<br clear="all">Hello,<br><br>I am usng g_hbond to calculate H bond auto correlation during the simulation for two residues in my system, I have two doubts regarding this:<br><br>1)How to use -acflen to calculate autocorrelation for all the frames instead of half of the frames<br>
2) What is the use of -temp option in calculating the autocorrelation because it is giving same result whether you use 298K or 500K<br><br>I have read the manual but I am not clear about these functions.<br>-- <br><font color="#3333ff"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif"><div>
---------------------------------<br>Thanks and regards<br></div><div><span style="font-family: arial; font-style: normal;"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">Bipin Singh</font></i></span></div></font></i></font><div>
<font color="#3333ff" face="arial, helvetica, sans-serif"><i><br></i></font></div><br>