Dear gmx users,<br><br>Since I am new to surface tension topic I need to ask very trivial questions. Please help me out with these simple questions. <br><br>As
 a starting point I am going to calculate surface tension of a pure 
alkane in a cubic box and compare with experimental values.<br>

<br>1- g_energy is giving #Surf*SurfTen by default. On the other hand 
surface tension can be obtained by gamma = (Pzz - (Pxx+Pyy)/2) / Lz.  i.e Pres-XX-(bar),  Pres-YY(bar),  Pres--(bar)<br><br>Can
 anyone tell me what the difference between these two is?<br>

<br>2- In pressure coupling settings there is surface_tension option 
which I guess is applicable where surface tension needs to be kept 
fixed. If one want to calculate surface tension I dont think this option
 make sense. Am I right?<br>

<br>3- I am using the following setting: I calculate the average for a 
2ns run and different start times as shown below. Although T, P and 
other quantities are equilibrated after 200ps, surface tension is not 
giving a constant value. Is that because I am not using berenden P 
coupling? (As mentioned in the manual surface tension works with berendsen)<br>

<br>Pcoupl              =  Parrinello-Rahman            <br>Pcoupltype          =  isotropic                   <br>tau_p               =  1      1               <br>compressibility     =  4.5e-5          <br>ref_p               =  40       <br>


<br><br>time period for which average is calculated   Average       RMSD     Fluct.      Drift  Tot-Drift<br>-------------------------------------------------------------------------------<br>1-2000 ps run: #Surf*SurfTen                    6.43844    3588.74    3588.35   0.091406    182.721<br>


500-2000 ps    #Surf*SurfTen                   12.8518    3605.72    3605.26   0.132126    198.189<br>1000-2000ps   #Surf*SurfTen                    18.8821    3610.97     3610.8    0.11819    118.191<br>1500-2000ps   #Surf*SurfTen                     23.0072    3585.51    3584.93  -0.444037   -222.019<br>
<br><br>

<br>4- Assuming I am getting surface tension for a cubic box, to compare
 this with reported values in literature I need to divide by 6 (no. of 
surfaces)? <br><br>5- Does box six affect the results? (mine is 3.3 nm ).<br><br><br>Thank you,<br>
<br>
<br><br><br><br><br><br>