<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    That are different way:<br>
    1. Performing analysis directly on the cluster where 4.5.3 is
    installed<br>
    2. Installing gmx 4.5.3 on you laptop.<br>
    3. Writing a program that converts from 4.5.3 to 4.0.7 <br>
    <br>
    <br>
    <br>
    Il 12/03/2011 12:16, mohsen ramezanpour ha scritto:
    <blockquote
      cite="mid:AANLkTin1X4OsC6_XakX9JvVUB7Rj4NLFCC_5NhkXsjEh@mail.gmail.com"
      type="cite">thanks for your replies.<br>
      <br>
      Yes,you are correct.<br>
      Actually I need to analyze my trajectories and energy files .<br>
      I tried but I couldn't use from my energy.edr file in old
      version(4.0.7),it say:<br>
      "it seems you want to read edr file from version 4.1 or latter
      with old version "<br>
      Please let me know how can I solve this problem<br>
      Thanks in advance <br>
      <br>
      <div class="gmail_quote">On Sat, Mar 12, 2011 at 1:38 PM,
        Francesco Oteri <span dir="ltr">&lt;<a moz-do-not-send="true"
            href="mailto:francesco.oteri@gmail.com">francesco.oteri@gmail.com</a>&gt;</span>
        wrote:<br>
        <blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid
          rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left:
          1ex;">Hi mohsen,<br>
          I think that "I need to work with them in v.4.0.7" &nbsp;means that
          you need to ANALYZE your trajectory with gmx4.0.7. Is it
          correct?<br>
          If this is the case, problem should not arise with trajectory
          files.<br>
          <br>
          You should have problems only with topology that is not
          back-compatible.<br>
          However, for the majority of gmx programs, a pdb file that
          represents your system is sufficient.<br>
          <br>
          If you strictly need a .tpr file, I suggest you to create a
          new topology with the 4.0.7 version.<br>
          <br>
          <br>
          Il 12/03/2011 08:54, mohsen ramezanpour ha scritto:
          <div>
            <div class="h5"><br>
              <blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px
                solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex;
                padding-left: 1ex;">
                Dear All<br>
                <br>
                How can I read and work on outputs of one &nbsp;version of
                Gromacs with tools of other version?<br>
                Because I have run my program on cluster(version 4.5.3)
                ,but I need to work with them in v.4.0.7<br>
                <br>
                Suppose I have to work with this version and there is
                not any way to change versions neighter on cluster no on
                my laptop<br>
                Please let me know if there is any solution<br>
                thanks in advance for your guidances<br>
                Mohsen<br>
              </blockquote>
              <br>
            </div>
          </div>
          <div>
            <div class="h5">
              -- <br>
              gmx-users mailing list &nbsp; &nbsp;<a moz-do-not-send="true"
                href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
              <a moz-do-not-send="true"
                href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users"
                target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
              Please search the archive at <a moz-do-not-send="true"
                href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search"
                target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a>
              before posting!<br>
              Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use
              the www interface or send it to <a moz-do-not-send="true"
                href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org"
                target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
              Can't post? Read <a moz-do-not-send="true"
                href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists"
                target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
            </div>
          </div>
        </blockquote>
      </div>
      <br>
    </blockquote>
    <br>
  </body>
</html>