Hello,<br>I am using g_covar vailable in user contributed section (by Ran Friedman) the description available for the package is as follows:<br><br>&quot;This package contains a modified version of g_covar, which can print a matrix<br>
of atomic correlation coefficients (with -xpmc) and write all pairs with a<br>correlation &gt; 0.5 to a log file (with -clog). Otherwise it is the same as the<br>original program. <br>The xpm correlation matrix shows only cross-correlations larger than 0.5<br>
(absolute values) on the upper triangle and all values on the lower<br>triangle. Thus, the upper triangle displays only the most correlated motions.&quot;<br><br clear="all">As stated that the upper triangle only shows the cross-correlation greater than<br>
0.5, but I am also getting some negative correlation values(blue regions) in above triangle.<br>I don&#39;t know what is the region behind this.<br>Plz help me to understand this behaviour.<br>I have attached my xpm matrix file generated using g_covar. <br>
-- <br><font color="#3333ff"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif"><div>---------------------------------<br>Thanks and regards<br></div><div><span style="font-family: arial; font-style: normal;"><i><font face="arial, helvetica, sans-serif">Bipin Singh</font></i></span></div>
</font></i></font><div><font color="#3333ff" face="arial, helvetica, sans-serif"><i><br></i></font></div><br>