<br /><br /><span>On 14/03/11, <b class="name">Yulian Gavrilov </b> &lt;zzeppelin87@gmail.com&gt; wrote:</span><blockquote cite="mid:AANLkTikkK8raC4dRX3G+ZPhZN_2vA4mR6dRRnpjJKd6S@mail.gmail.com" class="iwcQuote" style="border-left: 1px solid rgb(0, 0, 255); padding-left: 13px; margin-left: 0pt;" type="cite"><div class="mimepart text html"><div dir="ltr"><br clear="all" />Dear gromacs users,<br />Please, can you explain the structure of <b>ffamber99.hdb </b>file<b><br /><br /></b>For example,<br />LYN    7<br />1    1    H    N    -C    CA    <br />1    5    HA    CA    N    CB    C    <br />
2    6    HB    CB    CA    CG    <br />2    6    HG    CG    CB    CD    <br />2    6    HD    CD    CG    CE    <br />2    6    HE    CE    CD    NZ    <br />2    3    HZ    NZ    CE    CD<br /></div></div></blockquote><br />What is not clear in the explanation of the hydrogen database in chapter 5 of the manual?<br /><br />Mark