<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 TRANSITIONAL//EN">
<HTML>
<HEAD>
  <META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; CHARSET=UTF-8">
  <META NAME="GENERATOR" CONTENT="GtkHTML/3.24.1.1">
</HEAD>
<BODY>
Hi<BR>
very recently I faced the same problem with a system that gives micelles of different geometries and, as far as I saw, g_order don't do that. Then I decided to compute a kind of local order parameters defined as:<BR>
<BR>
S_i=(3 cos(\theta)-1)/2 <BR>
<BR>
where theta is the angle between the segments joining the carbon atoms (i-1,i+1) and (i, i+2) in a linear C-chain. Perhaps you find this reasonable for your analysis...<BR>
<BR>
Cheers,<BR>
<BR>
&#193;ngel.<BR>
<BR>
<BR>
<BR>
On Mon, 2011-03-14 at 18:25 +0100, sa wrote:<BR>
<BLOCKQUOTE TYPE=CITE>
    Dear all,<BR>
    <BR>
    I would like to compute the order parameter tensor elements of a DPC micelle with respect to a vector direction (for example the vector from the<BR>
    center of mass of the micelle to the phosphorus atom). It is possible with g_order (4.5.3). if yes how ? <BR>
    <BR>
    Thank you in advance. <BR>
    <BR>
    <BR>
<PRE>
-- 
gmx-users mailing list    <A HREF="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</A>
<A HREF="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</A>
Please search the archive at <A HREF="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</A> before posting!
Please don't post (un)subscribe requests to the list. Use the 
www interface or send it to <A HREF="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</A>.
Can't post? Read <A HREF="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</A>
</PRE>
</BLOCKQUOTE>
</BODY>
</HTML>