<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Dear all..<br><br>I am using g_membed tools to embed the protein into lipid membrane. I read that before doing g_membed we need to run a short run with some options in .mdp files. <br>what are the steps do we need to do before g_membed. It is given that box size should be taken from the membrane strucuture file but i don t know how and where to mention the size?<br>Whether any tutorial is available for transmembrane protein using g_membed tool?<br><br>Thank you<br><br>Mohanalakshmi N.<br></td></tr></table><br>