Dear All<br><br>I did a pulling simulation for protein-drug system.<br><br>My output (pull.xvg) has a pick in 100 ps (equivalent to 1 nm),<br>the rest of plot is flat(of course with oscilation around the average),of course with NOT ZERO average in the flat region.<br>
<br>Can I result ?<br>&quot; the interaction between protein and drug has finished after 1 nm&quot;<br><br>If yes, why the average of flat region is not zero(after the pick)?<br><br>Thanks in advance<br>