Hello users,<br><br>Although there was already much discussion had been done on the procedure to<br>construct DCCM map from covar.dat(i.e. output from g_covar) but still I am not clear <br>with the step wise procedure to calculate the correlation matrix from covarience matrix(covar.dat).<br>
<br>1) It is stated in the previous posts that to calculate correlation matrix we have to <br>divide each i,j-th element of the covariance matrix (covar.dat) by the sqrt of the  ii-th and jj-th diagonal<br>element, but how to get diagonal of a 865107X3 matrix???<br>
2) As given in the manual the order of elements in covar.dat is is: x1x1,x1y1, x1z1, x1x2, ...<br>But I am not clear which are i,j-th ,ii-th and jj-th elements in covar.dat.<br><br>My covarience matrix have  865107 rows and 3 columns and the total atoms are 537(sqrt( 865107 X 3) / 3=537 atoms) <br>
Can anyone suggest how to transform the covar.dat into correlation matrix.<br>I am expecting the stepwise procedure to construct the correlation matrix and not the theory behind it as it already stated in the<br>previous posts. <br clear="all">
<br>-- <br><span style="color: rgb(51, 51, 255);">-----------------------</span><br style="color: rgb(51, 51, 255);"><i><span style="color: rgb(51, 51, 255);">Regards,</span></i><br style="color: rgb(51, 51, 255);"><span style="color: rgb(51, 51, 255); font-family: garamond,serif;">Bipin Singh</span><br>
<br>