Hello List<div><br></div><div>I want to change an ASP to a D-ASP. I think it should be possible by simply changing 2 improper values around the chiral carbon to their opposite sign. Instead of making a brand new residue, I thought I would take the topology of an ASP generated by pdb2gmx, and simply change values manually in the resulting .itp. However, this is not possible because gromacs wants to read the dihedral parameters from the ffbonded.itp file. Is it possible for me to explicitly state the parameters for these two dihedrals in my d-asp.itp file? This will be the fastest solution to the problem because it precludes making a new residue or defining new atoms types and so on. With the CHARMM force field, I am not sure how <span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>q0<span class="Apple-tab-span" style="white-space:pre">        </span>cq translate to c0 c1 c2 and c3 which we are used to for gromos topologies.</div>
<div><br></div><div>The mailing list search function was down, so I could not explore prior messages about this.</div><div><br></div><div>--</div><div><br></div><div>Maria<br clear="all"><br>-- <br>Maria G.<br>Technical University of Denmark<br>
Copenhagen<br>
</div>