<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii">
<META content="MSHTML 6.00.6000.17095" name=GENERATOR></HEAD>
<BODY>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=593140419-28032011>Gmx-users,</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=593140419-28032011></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=593140419-28032011>I am in the process 
of deciding on a force field library for a MD simulation. In reading Lemkul et 
al I get the impression that</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=593140419-28032011>GROMOS96 43A1 is 
probably the one to use. I am&nbsp;trying to do a simulation with a ligase 
that&nbsp; binds ADP, 2Mg, D-alanine and D-lactate.&nbsp; From 
these</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=593140419-28032011></SPAN></FONT><FONT 
face=Arial size=2><SPAN class=593140419-28032011>&nbsp;authors, I have the 
impression that PRODRG&nbsp; is probably not the way to go.&nbsp; Are there 
other possibilities? or should I stick to&nbsp;43A1? Comment</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=593140419-28032011>Thx.</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=593140419-28032011></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN class=593140419-28032011>Frank 
Neuhaus&nbsp;</SPAN></FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2><SPAN 
class=593140419-28032011></SPAN></FONT>&nbsp;</DIV></BODY></HTML>