Hi All,<div><br></div><div>I am installing GROMACS using cygwin.</div><div><br></div><div>I am following the steps as mentioned :</div><div><a href="http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions/Cygwin_HOWTO">http://www.gromacs.org/Downloads/Installation_Instructions/Cygwin_HOWTO</a></div>
<div><br></div><div><b>no 5, make install command give the following error in the end :</b></div><div><div><br></div><div><div>ng&#39;</div><div>Creating library file: .libs/libgmx.dll.a</div><div>collect2: ld returned 1 exit status</div>
<div>make[3]: *** [<a href="http://libgmx.la">libgmx.la</a>] Error 1</div><div>make[3]: Leaving directory `/cygdrive/d/softwares/bioinformatics/gromacs-4.5.4/s</div><div>rc/gmxlib&#39;</div><div>make[2]: *** [install-recursive] Error 1</div>
<div>make[2]: Leaving directory `/cygdrive/d/softwares/bioinformatics/gromacs-4.5.4/s</div><div>rc/gmxlib&#39;</div><div>make[1]: *** [install-recursive] Error 1</div><div>make[1]: Leaving directory `/cygdrive/d/softwares/bioinformatics/gromacs-4.5.4/s</div>
<div>rc&#39;</div><div>make: *** [install-recursive] Error 1</div></div></div><div><br></div><div>and<b> make links command gives the following error:</b></div><div><b><br></b></div><div><b><div>$ make links</div><div>cd /usr/local/gromacs/bin &amp;&amp; programs=`ls` &amp;&amp; cd /usr/local/bin &amp;&amp; \</div>
<div>        for i in $programs; do \</div><div>           (test ! -f $i &amp;&amp; ln -s /usr/local/gromacs/bin/$i . ; exit 0); \</div><div>        done</div><div>/bin/sh: line 0: cd: /usr/local/gromacs/bin: No such file or directory</div>
<div>make: *** [links] Error 1</div><div><br></div><div>Can anyone de-code thsi error and help me how should I successfully proceed for the same. </div><div><br></div><div>Thanks in advance.</div><div><br></div><div>Monisha </div>
</b></div><div><br></div><div><br></div><div><br></div>