Dear Justin,<br><br>I have Fatal Errror:The solvent group Water is not continuous. I look at gmx-users mailing list search. I also have the same problem.<br>You said:(<a href="http://lists.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2010-January/048344.html">http://lists.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2010-January/048344.html</a>)<br>
<pre>It is exactly what I said; you&#39;ve proven it. You have solvent, ligand, then<br>solvent. To use genion (as the program prints out at the prompt) you must have<br>a *continuous* group of solvent in order to embed ions. If you re-arrange the<br>
coordinate file and [molecules] section of the topology, you can achieve this.<br></pre><br>How can I do the re-arrange you said? <span id="result_box" class="short_text" lang="en"><span title="Alternatif çevirileri görmek için tıklayın" class="hps">Can you explain</span> <span title="Alternatif çevirileri görmek için tıklayın" class="hps">a little bit?<br>
<br>Thanks<br></span></span><br><br><br clear="all"><br>-- <br>Ahmet YILDIRIM<br>