<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><P style="MARGIN: 0cm 0cm 10pt" class=MsoNormal><SPAN style="mso-ansi-language: TR" lang=TR><FONT size=3><FONT face=Calibri>Dear gmx users,<?xml:namespace prefix = o ns = "urn:schemas-microsoft-com:office:office" /><o:p></o:p></FONT></FONT></SPAN></DIV>
<P style="MARGIN: 0cm 0cm 10pt" class=MsoNormal><SPAN style="mso-ansi-language: TR" lang=TR><FONT size=3 face=Calibri>I’m a NAMD user and want to use gromacs 4.5.4 analysis tools for my NAMD output files. I have some NAMD output files : </FONT></SPAN><TT><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-SIZE: 10pt; mso-fareast-font-family: Calibri">output.coor , output.vel , output.dcd </SPAN></TT><TT><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 12pt; mso-fareast-font-family: Calibri">(binary </SPAN></TT><FONT face=Calibri><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-SIZE: 12pt">coordinate trajectory output file</SPAN><TT><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 12pt; mso-fareast-font-family: Calibri">). Can I convert these output files into gromacs output files and use </SPAN></TT><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-SIZE: 12pt; mso-ansi-language: TR" lang=TR>gromacs 4.5.4 analysis tools ? If it’s
 possible to do it, could you please explain this job ? <o:p></o:p></SPAN></FONT></DIV>
<P style="MARGIN: 0cm 0cm 10pt" class=MsoNormal><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-SIZE: 12pt; mso-ansi-language: TR" lang=TR><FONT face=Calibri>Thanks in advance<o:p></o:p></FONT></SPAN></DIV><SPAN style="LINE-HEIGHT: 115%; FONT-FAMILY: 'Calibri','sans-serif'; FONT-SIZE: 12pt; mso-ansi-language: TR; mso-fareast-font-family: Calibri; mso-bidi-font-family: 'Times New Roman'; mso-fareast-language: EN-US; mso-bidi-language: AR-SA" lang=TR>M</SPAN></td></tr></table>