Dear Dr.Mark<br><br>thank you for your attention<br>How long is enough?<br>for example I have run 200 ps for making npt(p=1 bar) for my system (300 nm^3)<br>But the pressure is oscilating so much,and I can&#39;t be sure if it has converged or not!<br>
of course its average is approximately 5 bar (at the end of log file)<br><br>Do you have any idea?<br>I know it is not any problem if a quantity is oscilating around it&#39;s converged value.<br><br>thanks in advance for your reply<br>
<br><div class="gmail_quote">On Sun, Apr 10, 2011 at 3:09 PM, Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
<div class="im">On 10/04/2011 6:48 PM, mohsen ramezanpour wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; padding-left: 1ex;">
Dear All<br>
<br>
How can I determine the converged value of a simulation?<br>
Because the pressure has big oscilations around it&#39;s converging value but it is difficult to determine that value.<br>
</blockquote>
<br></div>
Longer simulations on bigger systems.<br>
<br>
Mark<br><font color="#888888">
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></blockquote></div><br>