Dear Gromacs users,<br><br>  I got different free energy values by Thermodynamic Integration (TI) in Gromacs 4.0.7 and 4.5.3.<br><br> When I calculated the hydration free energy of Chloride ion by using Thermodynamic Integration method, the results for the free energy of un-charging the Chloride ion from q=-e to 0 in SPC water are 359+/-6 kJ/mol in Gromacs 4.0.7 and 385 +/-6 kJ/mol in Gromacs 4.5.3, respectively.<br>
<br>  The literature value is 392 kJ/mol (J. Phys. Chem. 1996, 100, 1206-1215, Table 6), which is close to the result in Gromacs 4.5.3 but not in 4.0.7.<br><br>  As a check, Gromacs 3.3.1 gave the result as 381+/-3 kJ/mol.<br>
<br>  I searched the mail list and the bugzilla of Gromacs but didn&#39;t find explanation for this issue of version.<br><br>  Does anyone know the reason for the different TI free energy values in those different version of Gromacs?<br>
<br>  Thanks!<br><br>    Yan<br><br><br>