<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;"><DIV>Dear Mark</DIV>
<DIV>What do you mean by running .tpr in serial?</DIV>
<DIV><BR>Thanks in advance</DIV>
<DIV>D.aghaie</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV><BR>--- On <B>Sat, 4/16/11, Mark Abraham <I>&lt;Mark.Abraham@anu.edu.au&gt;</I></B> wrote:<BR></DIV>
<BLOCKQUOTE style="PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: rgb(16,16,255) 2px solid"><BR>From: Mark Abraham &lt;Mark.Abraham@anu.edu.au&gt;<BR>Subject: Re: [gmx-users] error in running jobs in parallel !!!<BR>To: "Discussion list for GROMACS users" &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<BR>Date: Saturday, April 16, 2011, 1:42 PM<BR><BR>
<DIV id=yiv182239086>On 16/04/2011 7:06 PM, delara aghaie wrote: 
<BLOCKQUOTE type="cite">
<TABLE cellSpacing=0 cellPadding=0 border=0>
<TBODY>
<TR>
<TD vAlign=top>
<DIV>Dear Justin</DIV>
<DIV>thanks for your previous explanations.</DIV>
<DIV>We are running job with gromacs in parallel. after having the outpus of the first run, when submitting the jobs for the next 10ns we encounter with this error. can you help me to fix that. Pleas let me know the possible reasons to see this kind of error.</DIV></TD></TR></TBODY></TABLE></BLOCKQUOTE><BR>Anything could cause that - including some problem with the hardware - and we can see no diagnostic information. Look at the .log file also. Try to run the .tpr in serial.<BR><BR>Mark<BR><BR></DIV></BLOCKQUOTE></td></tr></table>