Hi,<br><br>I am dealing with a special case of trajectory concatenation: I have several equilibration trajectories that their times are always restarted to 0, due employing different force constants for positional restraints, but using the output structure of the previous step as input anyway. Using trjcat, it obviously works when you do:<br>
<br>trjcat -f traj1.xtc traj2.xtc traj3.xtc traj4.xtc traj5.xtc traj6.xtc -o traj_all.xtc -settime<br><br>and you interactively introduce &#39;c&#39; (continue) for each case (there are no overlapping frames). I haven&#39;t found a way to continue the trajectory times without using -settime (neither -cat nor -keeplast), with both versions 4.0.7 or 4.5. At the same time, I&#39;ve tried to introduce the &#39;c&#39; value in a non-interactive way (as indicated in <a href="http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Making_Commands_Non-Interactive">http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Making_Commands_Non-Interactive</a>) when using -settime, but it doesn&#39;t recognize it. <br>
<br clear="all">I was wondering if there is a way to make the above mentioned command-line to work non-interactively. The same applies for the eneconv tool when concatenating .edr files.<br><br>Thanks in advance,<br><br>-- <br>
<pre cols="72">David Rodríguez Díaz, PhD Student<br>Fundación Pública Galega de Medicina Xenómica (SERGAS)<br>Santiago de Compostela (Spain)<br><a href="http://webspersoais.usc.es/persoais/david.rodriguez.diaz" target="_blank">http://webspersoais.usc.es/persoais/david.rodriguez.diaz</a></pre>

<a href="http://webspersoais.usc.es/persoais/david.rodriguez.diaz" target="_blank"></a><br>