<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
    <title></title>
  </head>
  <body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
    On 4/25/2011 6:26 PM, Sajad Ahrari wrote:
    <blockquote cite="mid:903894.6992.qm@web31704.mail.mud.yahoo.com"
      type="cite">
      <style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style>
      <div style="font-family: arial,helvetica,sans-serif; font-size:
        12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
        <div>dear users<br>
          is there any way to introduce "ADP" and "ATP" to Gromacs? my
          protein holds these ligands. but they are not known to
          Gromacs.<br>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    Some of the GROMACS force fields have ATP.<br>
    <br>
    Otherwise, the advice here
    <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Parameterization">http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Parameterization</a> is
    appropriate.<br>
    <br>
    Mark<br>
  
</body>
</html>