Dear gmx-users,<div><br></div><div>I intended to concantanate two trajectories with no similar time frames i.e., both files have distinct time frames. But once I combine the files many time frames are skipped, details are as follows:</div>

<div><br></div><div>File 1 has 2175 frames</div><div>File 2 has 1232 frames</div><div><br></div><div>I used the following command to concatenate:</div><div><br></div><div>trjcat -f File1.xtc File2.xtc -o CombinedFile3.xtc</div>

<div><br></div><div>Now I obtained in total 1266 frames instead of 3407 frames as expected. When I compared the CombinedFile3 with both File 1 and File 2, I found that it has somehow taken the first  34 frames from File 1 and rest of the frames belongs to File 2 i.e., the last file.</div>

<div><br></div><div>I am unable to understand why trjcat skips the frames inspite of no similarity. I am using 4.5-beta version of Gromacs. I am also open to sharing the files, should that be needed.</div><div><br></div>
<div>
Any possible explanation as to why I am obtaining the combined trajectory with skipping frames, would be really helpful.</div><div><br></div><div>Many Thanks,</div><div>Lipi</div>