Thank you<br><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 28, 2011 at 6:26 PM, Ran Friedman <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:ran.friedman@lnu.se">ran.friedman@lnu.se</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Hi,<br>
<br>
That&#39;s unlikely, but maybe the following publications can help you to build the surface:<br>
<br>
<br>
@Article{Iori2008,<br>
author = &quot;Iori, F and Corni, S&quot;,<br>
title = {Including image charge effects in the molecular dynamics simulations of molecules on metal surfaces},<br>
journal = &quot;J Comput Chem&quot;,<br>
year = &quot;2008&quot;,<br>
volume = &quot;29&quot;,<br>
pages = &quot;1656-1666&quot;<br>
}<br>
<br>
@Article{Iori2009,<br>
author = &quot;Iori, F and Di Felice, R and Molinari, E and Corni, S&quot;,<br>
title = {{G}ol{P}: {A}n atomistic force-field to describe the interaction of proteins with {A}u(111) surfaces in water},<br>
journal = &quot;J Comput Chem&quot;,<br>
year = &quot;2009&quot;,<br>
volume = &quot;30&quot;,<br>
pages = &quot;1465-1476&quot;<br>
}<br>
<br>
@article{Kalcher2009,<br>
Author = {Kalcher, I. and Horinek, D. and Netz, R. R. and Dzubiella, J.},<br>
Title = {{Ion specific correlations in bulk and at biointerfaces}},<br>
Journal = {JOURNAL OF PHYSICS-CONDENSED MATTER},<br>
Year = {{2009}},<br>
Volume = {{21}},<br>
Article-Number = {{424108}}<br>
}<br>
<br>
------------------------------------------------<br>
Ran Friedman<br>
Biträdande Lektor (Assistant Professor)<br>
<br>
Linnaeus University<br>
School of Natural Sciences<br>
391 82 Kalmar, Sweden<br>
<br>
Norrgård, room 328d<br>
<a href="tel:%2B46%20480%20446%20290" value="+46480446290">+46 480 446 290</a> Telephone<br>
<a href="tel:%2B46%2076%20207%208763" value="+46762078763">+46 76 207 8763</a> Mobile<br>
<a href="mailto:ran.friedman@lnu.se">ran.friedman@lnu.se</a><br>
<a href="http://lnu.se/ccbg" target="_blank">http://lnu.se/ccbg</a><br>
------------------------------------------------<br>
<br>
Hello, does anybody have an idea if there are availbale PDB files which<br>
represent metal surfaces for transition state metals, to be used for MD?<br>
<br>
BW<br>
<br>
S<br>
<font color="#888888">--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></blockquote></div><br>