Dear experts,<br><br>I just tried the command  mpirun -np 4 mdrun on 4.5.4 but after a few steps I get LINCS error:<br><br>step 400, will finish Sat Apr 30 05:20:45 2011<br>Step 750, time 1.5 (ps)  LINCS WARNING<br>relative constraint deviation after LINCS:<br>
rms 10.116560, max 72.359520 (between atoms 314 and 315)<br>bonds that rotated more than 30 degrees:<br> atom 1 atom 2  angle  previous, current, constraint length<br>    301    302   61.0    0.1090   0.1841      0.1090<br>
<br><br>I tried to run using the same input files on 4.0.7 and simulation worked fine. I mean the LINCS is not because of flawed topology or instability issue. I am wondering this is happening because of MPI or installation ..Please help! <br clear="all">
<br>-- <br>Thanks,<br><br>