;RESI MEOH 0.00 ! methanol, adm jr. ;GROUP ! order of atoms to match that used in ab initio ;ATOM C1 CT3 -0.04 ! H11 ;ATOM O1 OH1 -0.66 ! \ ;ATOM HO1 H 0.43 ! H12--C1--O1 ;ATOM H11 HA 0.09 ! / \ ;ATOM H12 HA 0.09 ! H13 HO1 ;ATOM H13 HA 0.09 ! ; Methanol, Jorgensen et al. JACS 118 pp. 11225 (1996) ; [ moleculetype ] ; name nrexcl MET 3 [ atoms ] ; nr type resnr residu atom cgnr charge mass 1 CT3 1 MET C1 1 -0.04 2 HA 1 MET H11 2 0.09 3 HA 1 MET H12 3 0.09 4 HA 1 MET H13 4 0.09 5 OH1 1 MET O1 5 -0.66 6 H 1 MET HO1 6 0.43 [ bonds ] ; ai aj funct b0 kb 1 2 1 1 3 1 1 4 1 1 5 1 5 6 1 [ pairs ] ; i j funct 2 6 1 3 6 1 4 6 1 [ angles ] ; ai aj ak funct theta ktheta ; H3 2 1 5 5 3 1 5 5 4 1 5 5 4 1 3 5 4 1 2 5 3 1 2 5 1 5 6 5 ; [ dihedrals ] ; ai aj ak al funct phi kphi n 2 1 5 6 9 3 1 5 6 9 4 1 5 6 9