Hi all<br><br>I got .itp and .pdb files of sulfate ion from PRODRG. I add it as an extra molecule (in genbox using -ci) my simulation box. I can see it visaully by VMD in my system. but it is not in topol.top and when I want run my program I receive the following error:<br>
<br>&quot;No molecules were defined in the system&quot;<br><br>The name of .itp file, its inclusion in topol.top are the same.<br><br>Would you please help me?What should I do?<br><br><br>Thanks alot<br><br>Maria<br><br>   <br>