<p style="margin: 0px; padding: 0px;">Dear all,<br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;"><br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">I'm trying install do_dssp on my pc.</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">I followed the steps indicated in the page:<br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">http://lists.gromacs.org/pipermail/gmx-users/2010-November/055728.html</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;"><br>&gt;&gt; 1.step-root at ab-desktop:/path-dsspcmbi.tar.gz/# tar xvzf dsspcmbi.tar.gz<br>&gt;&gt; 2.step-root at ab-desktop:/path-dsspcmbi.tar.gz/dssp#./DsspCompileGCC<br>&gt;&gt; 3.step-root at ab-desktop:/path-dsspcmbi.tar.gz/dssp# cp dsspcmbi dssp<br>&gt;&gt; 4.step-root at ab-desktop:/path-dsspcmbi.tar.gz/dssp# mv dssp /usr/local/bin</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;"><br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">and the program work well.</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;"><br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">Now my question:</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">How the program use the file that I downloaded from the web-page:</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">http://swift.cmbi.ru.nl/gv/dssp/&nbsp;&nbsp; using the indicated instruction? </p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">(I found this page from http://www.gromacs.org/Developer_Zone/Programming_Guide/DSSP)</p><p><font><font face="Courier">
<pre>rsync -avz rsync://rsync.cmbi.ru.nl/dssp/ /path_to_dssp/<br></pre>
</font></font></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">The link&nbsp; <font face="Courier"></font>rsync://rsync.cmbi.ru.nl/dssp/&nbsp; is one of the best&nbsp; <font><i><font face="Arial"><i>database </i></font></i></font>to calculate the angle into the secondary structures and so to define that, isn't it?<br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;"><br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">Thanks,</p><p style="margin: 0px; padding: 0px;"><br></p><p style="margin: 0px; padding: 0px;">Anna<br></p>