<div>Hi,</div>
<div> </div>
<div>BioVEC is a tool for visualizing molecular dynamics simulation data while allowing coarse-grained residues to be<font face="Arial,Helvetica,Geneva,Swiss,SunSans-Regular">rendered as ellipsoids.</font></div>
<div><a href="http://www.phas.ubc.ca/~steve/BioVEC/BioVECindex.html">http://www.phas.ubc.ca/~steve/BioVEC/BioVECindex.html</a><br><br></div>
<div class="gmail_quote">2011/5/10 Mark Abraham <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:Mark.Abraham@anu.edu.au">Mark.Abraham@anu.edu.au</a>&gt;</span><br>
<blockquote style="BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class="gmail_quote">
<div>
<div></div>
<div class="h5">On 10/05/2011 8:23 PM, lammps lammps wrote:<br>
<blockquote style="BORDER-LEFT: #ccc 1px solid; MARGIN: 0px 0px 0px 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class="gmail_quote">Hi,<br>I want to study the shape change of a macromolecule which seems like a ellipsoid.  So, I need obtain the three principal moments of the molecules.<br>
Is the command of g_gyrate helpful for me? The sum of the three principal moments should be equal to the &lt;Rg^2&gt;.  However, I used the command g_gyrate -f traj.gro -s nvt.tpr -n anly.ndx -o shape.xvg -p obtain the Rg and other three qualities.<br>
It seems that the sum of the last three qualities is not equal to the Rg^2. Is there something wrong?<br></blockquote><br></div></div>Why should that sum equal Rg^2?<br><br>Mark<br><font color="#888888">-- <br>gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Ahmet YILDIRIM<br>