<div dir="ltr">


        <meta http-equiv="CONTENT-TYPE" content="text/html; charset=utf-8"><title></title><meta name="GENERATOR" content="OpenOffice.org 2.0  (Unix)"><meta name="AUTHOR" content="gavrilov"><meta name="CREATED" content="20110519;14350400"><meta name="CHANGED" content="16010101;0">
        
        
        
        
        
        <style>
        <!--
                @page { size: 8.5in 11in; margin: 0.79in }
                P { margin-bottom: 0.08in }
        -->
        </style>

<p style="margin-bottom: 0in;">Dear gromacs users,<br>1. I have got 3
MD-outputs for the same protein (3 runnings for 100 ns).<br>I want to
make a distance matrix (<b>g_mdmat</b>) for the average trajectory of
these 3 runnings.  <br><b>g_mdmat</b> gives an average  matrix
for one trajectory, but I want to get it for the average
trajectory.<br>I tried to use <b>xpm2ps</b> to get average matrix,
but in it I can only combine matrices (not to take an average
matrix).<br>Can I get an average matrix, or an average trajectory?<br><br></p><br>-- <br>Sincerely,<br><br>Yulian Gavrilov<br><br></div>