
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

  <head>

    <meta content="text/html; charset=windows-1252"

      http-equiv="Content-Type">

  </head>

  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">

    On 23/05/2011 6:57 PM, rashi parihar wrote:

    <blockquote

      cite="mid:BANLkTiktJ_RaVea+w-c268_ERnq460y+aA@mail.gmail.com"

      type="cite"><br clear="all">

      Hi all<br>

      I have an ligand having NI atom(Nickel) .Now problem is this when

      I am running PRODRG server ,ligand topology can not be created and

      error is coming <br>

      <pre><font size="4"><b><span style="color: rgb(102, 51, 255);">unsupported atom type NI (atom 'NI2 ') in your coordinates</span></b></font>.<font size="4">now how to overcome this problem? plz help me!!</font>

</pre>

    </blockquote>

    <br>

    See <a

      href="http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Parameterization">http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Parameterization</a><br>

    <br>

    Mark<br>

  </body>

</html>