<HTML>

<HEAD>

<META content="text/html; charset=big5" http-equiv=Content-Type>

<META content="OPENWEBMAIL" name=GENERATOR>

</HEAD>

<BODY bgColor=#ffffff>

<font size="2">Hi,

<br />

<br />Thank you.

<br />I use gcc v4.4 and complete the installing.

<br />

<br />Sincerely yours,

<br />Hsin-Lin

<br />&gt; 

Hi, 

<br />&gt; 

<br />&gt; 

That compiler is ancient (thought it might have SSE2 support) as well 

<br />&gt; 

as the OS, I guess (RHEL 3?). Still, the CPU does support SSE2 so if 

<br />&gt; 

you can get a gcc 4.1 or later on it you should still be able compile 

<br />&gt; 

and run the code without a problem. 

<br />&gt; 

<br />&gt; 

-- 

<br />&gt; 

Szilárd 

<br />&gt; 

<br />&gt; 

2011/5/26 Hsin-Lin Chiang &lt;jiangsl@phys.sinica.edu.tw&gt;: 

<br />&gt; 

&gt; Hi, 

<br />&gt; 

&gt; 

<br />&gt; 

&gt; Thank you for your reply. 

<br />&gt; 

&gt; I'm not so good in computer. 

<br />&gt; 

&gt; I think the platform you ask me is &quot;Linux&quot;, and kernel is 

2.4.21-60.ELsmp 

<br />&gt; 

&gt; The compiler is gcc v3.2.3 in the machine in my institute. 

<br />&gt; 

&gt; 

<br />&gt; 

&gt; Sincerely yours, 

<br />&gt; 

&gt; Hsin-Lin 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Message: 1 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Date: Thu, 26 May 2011 18:03:09 +0200 

<br />&gt; 

&gt;&gt; From: Szil?rd P?ll &lt;szilard.pall@cbr.su.se&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Subject: Re: [gmx-users] Error of installing gromacs v4.5.4 

<br />&gt; 

&gt;&gt; To: Discussion list for GROMACS users &lt;gmx-users@gromacs.org&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Message-ID: &lt;BANLkTi=9v3+1Dnbjsmd6hna-ayFdpRbTOA@mail.gmail.com&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1 

<br />&gt; 

&gt;&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Hi Hsin-Lin, 

<br />&gt; 

&gt;&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Your problem are caused by a missing header file which is included by 

<br />&gt; 

&gt;&gt; the nobonded SSE kernels which is indicated by the first error in your 

<br />&gt; 

&gt;&gt; output: 

<br />&gt; 

&gt;&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; nb_kernel400_ia32_sse.c:22:23: emmintrin.h: No such file or directory 

<br />&gt; 

&gt;&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; This header is needed for SSE and SSE2, but for some reason you don't 

<br />&gt; 

&gt;&gt; have it. What platform are you compiling on/for and what compiler are 

<br />&gt; 

&gt;&gt; you using? 

<br />&gt; 

&gt;&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Alternatively, you can turn off acceleration and you'll be able to 

<br />&gt; 

&gt;&gt; compile the code, but it will run *much* slower than with the 

<br />&gt; 

&gt;&gt; accelerated kernels. 

<br />&gt; 

&gt;&gt; 

<br />&gt; 

&gt;&gt; -- 

<br />&gt; 

&gt;&gt; Szil嫫d 

<br />

<br />

</font>

</BODY>

</HTML>