<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:'times new roman', 'new york', times, serif;font-size:12pt"><div>Hi,</div><div>&nbsp;&nbsp;I was running a replica exchange simulation in a PBS queue which was killed as my simulation crossed the maximum time limit. I was planning to restart the simulation. I am using gromacs 4.0.7&nbsp;</div><div>&nbsp;I was wondering what should be the command line arguement &nbsp;for the multiple .cpt file for restarting the replica exchange simulation.&nbsp;</div><div>My .cpt files are named like state0.cpt,state1.cpt,state2.cpt etc &nbsp;while my .tpr file topol_0.tpr,topol_1.tpr etc. &nbsp;Should I put state*.cpt &nbsp; for mentioning the multiple .cpt files ?</div><div>i.e&nbsp;</div><div>Will it be something like :</div><div>&nbsp;&nbsp;&nbsp;mpirun -np $NPROCS ~/UTIL_icc/gromacs-4.0.7/bin/mdrun_4mpi &nbsp;-cpi state*.cpt -s topol_.tpr -v -multi 40 -replex
 1000 &gt;&amp; log_replex_test</div><div>&nbsp;</div><div>Thanks</div><div>Sanku</div><div style="position:fixed"></div>


</div></body></html>