Hello gmx-users,<br><br>I am trying to install gmx-4.5.4 on a HPC Linux cluster x86_64. <br>1. I installed fftw 3.2.2<br clear="all">             ./configure --prefix /soft/sudip/abc/execs/fftw/  --enable-single --enable-threads<br>

2. Installing Gromacs : CPPFLAGS and LDFLAGS were written in bashrc file<br>    a)         ./configure --prefix=/soft/sudip/abc/execs/gromacs/<br>       execute successfully without any complain.<br>    b) make<br>             /usr/bin/ld: /soft/sudip/abc/execs/fftw/lib/libfftw3f.a(apiplan.o): relocation R_X86_64_32 against `a local symbol&#39; can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC<br>

             /soft/sudip/abc/execs/fftw/lib/libfftw3f.a: could not read symbols: Bad value<br>             collect2: ld returned 1 exit status<br>             make[3]: *** [<a href="http://libmd.la">libmd.la</a>] Error 1<br>

             make[3]: Leaving directory `/soft/sudip/abc/untar/gromacs-4.5.4/src/mdlib&#39;<br>             make[2]: *** [all-recursive] Error 1<br>             make[2]: Leaving directory `/soft/sudip/abc/untar/gromacs-4.5.4/src&#39;<br>

             make[1]: *** [all] Error 2<br>             make[1]: Leaving directory `/soft/sudip/abc/untar/gromacs-4.5.4/src&#39;<br>             make: *** [all-recursive] Error 1<br><br>      shows problem. <br><br>Couldnot understand the origin of problem. Kndly let me know if some information is missing.<br>

<br>Chandan<br><br>--<br>Chandan kumar Choudhury<br>NCL, Pune<br>INDIA<br>