<p>Hey,</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>You could use the path collective variables included in PLUMED (you have to compile it with gromacs) or maybe if you know an eigenvector that describes the motion you are interested in (from PCA for instance) you could do some floodin through it.</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>best</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>Felipe</p>
<blockquote>----Mensaje original----<br /> De: msanku65@yahoo.com<br /> Fecha: 04-jun-2011 19:42<br /> Para: &lt;gmx-users@gromacs.org&gt;<br /> Asunto: [gmx-users] Transition path sampling<br /> <br /> <!--<mce:style type="text/css"><!   DIV {margin:0px;} -> -->--&gt;
<div style="font-family:'times new roman', 'new york', times, serif;font-size:12pt">
<div>Hi ,</div>
<div>&nbsp;&nbsp; I was wondering whether current GROMACS versions can perform transition path sampling to study rare events ?</div>
<div>Sanku</div>
<div><br /></div>
</div>
<br /></blockquote>
<p>&nbsp;</p>