Dear Justin <br>
<br>
very thanks for your reply<br>
<br>
as you said I have two choices : 1)<font><font size="2"> copy and paste the two models into separate .pdb files</font></font>.<br>
<br>
2)<font><font size="2"> trjconv -sep</font></font>
.no matter which one I choose. the result is the same. because vmd don&#39;t open two separate pdb files?<br>
<br>
is there another way to have 2 structures simultaneously in one figure? (my goal is superposition of averaged md structure and x-ray structure)<br>
<br>
<br clear="all"><br>-- <br><pre style="font-family: arial,helvetica,sans-serif;">Leila Karami<br>Ph.D. student of Physical Chemistry<br>K.N. Toosi University of Technology<br>Theoretical Physical Chemistry Group</pre><br>