<p>Hey, </p>
<p>The rmsf and rmsd are themselves sort of standard deviations. They are chi distributed, and the confidence intervals are generally not characterized by a standard deviation, which would be a standard deviation of a standard deviation :p </p>

<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk</p>
<p><blockquote type="cite">On Jun 18, 2011 1:21 PM, &quot;Francesco Oteri&quot; &lt;<a href="mailto:francesco.oteri@gmail.com">francesco.oteri@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br>g_analyze -f file.xvg<br>
<br>
the program prints, for each data set, the average and standard deviation<br>
<br>
Il 18/06/2011 13:18, shahab shariati ha scritto:<p><font color="#500050">
&gt;
&gt; Dear gromacs users
&gt;
&gt; I want to know how to obtain standard deviation about rmsd and rmsf valu...</font></p><font color="#888888">
-- <br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org" target="_blank">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/<u></u>mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org" target="_blank">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/<u></u>Support/Mailing_Lists</a><br>
</font></blockquote></p>