<table cellspacing="0" cellpadding="0" border="0" ><tr><td valign="top" style="font: inherit;">Dear Justin, Thank you for your previous reply<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Dear Justin I used g_hbond&nbsp; tool i have got&nbsp; .xvg file&nbsp; In that file there are three column The second and third colum represents What ?.<br>Which column represents total no of Hbonds&nbsp; throught the entire trajectory and <br>which Columns represents Average number of H bonds<br>Thanks in Advance<br></td></tr></table>