<p>Hi Bipin,</p>
<p>Read them in as a vector of numbers and divide them into sqrt(len(vector)) rows to get yourself a nice square correlation matrix.</p>
<p>Cheers,</p>
<p>Tsjerk</p>
<p><blockquote type="cite">On Jun 24, 2011 3:28 PM, &quot;bipin singh&quot; &lt;<a href="mailto:bipinelmat@gmail.com">bipinelmat@gmail.com</a>&gt; wrote:<br><br>Hello,<br>I have some doubts regarding the output file correl.dat as it contains 3 columns, but I am not able to get what are<br>
these column contains,I mean how to change it to the format in which I can directly plot the data to get DCCM map...<br>
For e.g in this form<br>Res1  Res2  Correlation coefficient<br>x         y        z<p><font color="#500050">
On Sun, Jun 19, 2011 at 16:16, Tsjerk Wassenaar &lt;<a href="mailto:tsjerkw@gmail.com">tsjerkw@gmail.com</a>&gt; wrote:
&gt;
&gt; Of course you did......</font></p><span style="color:rgb(51, 51, 255)">-----------------------</span><br style="color:rgb(51, 51, 255)"><i><span style="color:rgb(51, 51, 255)">Regards,</span></i><br style="color:rgb(51, 51, 255)">
<font color="#888888">
<span style="color:rgb(51, 51, 255);font-family:garamond,serif">Bipin Singh</span><br><br>
</font><br>--<br>
gmx-users mailing list    <a href="mailto:gmx-users@gromacs.org">gmx-users@gromacs.org</a><br>
<a href="http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users" target="_blank">http://lists.gromacs.org/mailman/listinfo/gmx-users</a><br>
Please search the archive at <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists/Search</a> before posting!<br>
Please don&#39;t post (un)subscribe requests to the list. Use the<br>
www interface or send it to <a href="mailto:gmx-users-request@gromacs.org">gmx-users-request@gromacs.org</a>.<br>
Can&#39;t post? Read <a href="http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists" target="_blank">http://www.gromacs.org/Support/Mailing_Lists</a><br></blockquote></p>