Dear Justin and other gmx-users,<br><br>As per the journal article, Practical Considerations for Building GROMOS-Compatible Small-Molecule Topologies, PRODRG 2.5 server does not assign  charges compatible with GROMOS force field.<br>
PRODRG 2.5, however, assigns the correct atom types and bonded parameters.<br><br>I have to build 2,5-dihydroxybenzoic acid<br><br>Starting from PRODRG 2.5 produced .itp and further rectification is a good idea? If yes, what should be strategy?<br>
<br>And if PRODRG should not be my starting point at all, then how should I go about building the molecule/anion.<br><br><br>Please guide, as I am not well versed with gromacs.<br><br>Thanks,<br>SN<br><br><br><br><br><br>
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