<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
    <title></title>
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">
    On 4/07/2011 2:54 PM, Mr Bernard Ramos wrote:
    <blockquote
cite="mid:1309755284.29499.YahooMailClassic@web161518.mail.bf1.yahoo.com"
      type="cite">
      <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
        <tbody>
          <tr>
            <td style="font: inherit;" valign="top">
              <div>Hi everyone!</div>
              <div>&nbsp;</div>
              <div>I&nbsp;will be installing gromacs 4.5.x in another
                computer but this time with four cores. The PC runs in
                windows and I will be using cygwin.&nbsp;The instructions
                says:</div>
              <div>&nbsp;</div>
              <div>"If you want to run in parallel across a network, you
                need MPI. If you are running on a supercomputer you
                probably already have an optimized MPI version installed
                - consult your documentation or ask your system
                administrator. See below for information about how to
                make use of MPI.&nbsp; <em>As of GROMACS 4.5, threading is
                  supported, so for e.g multi-core workstations, MPI is
                  no longer required</em>"</div>
              <div>&nbsp;</div>
              <div>&nbsp;</div>
              <div>The last note says that I do not have to install MPI.
                Do I still need to install MPI using cygwin?</div>
            </td>
          </tr>
        </tbody>
      </table>
    </blockquote>
    <br>
    Probably not, but I haven't tested threading on Cygwin.<br>
    <br>
    <blockquote
cite="mid:1309755284.29499.YahooMailClassic@web161518.mail.bf1.yahoo.com"
      type="cite">
      <table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0">
        <tbody>
          <tr>
            <td style="font: inherit;" valign="top">
              <div> Or cygwin/windows will do the MPI for me.</div>
            </td>
          </tr>
        </tbody>
      </table>
    </blockquote>
    <br>
    Nothing will do MPI for you. Threading and MPI are complementary
    approaches to achieving parallelism, and which is better depends on
    your execution environment.<br>
    <br>
    Mark<br>
  </body>
</html>