<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
  <head>
    <meta content="text/html; charset=ISO-8859-1"
      http-equiv="Content-Type">
  </head>
  <body text="#000000" bgcolor="#ffffff">
    On 4/07/2011 3:40 PM, balaji nagarajan wrote:
    <blockquote cite="mid:SNT123-W3A9AA7776849DC11CA5FCE25C0@phx.gbl"
      type="cite">
      <style><!--
.hmmessage P
{
margin:0px;
padding:0px
}
body.hmmessage
{
font-size: 10pt;
font-family:Tahoma
}
--></style>
      <div dir="ltr">
        Dear Users ! <br>
        <br>
        I have a problem in taking the inter and intra molecular
        interaction energy from a pdb ,&nbsp; which is being minimized&nbsp; by
        minim.mdp ! <br>
        <br>
        when i use the <br>
        <br>
        g_energy -f&nbsp; *.edr&nbsp;&nbsp; it gives the list of all possible
        interaction energy as average value , but i want it only for the
        minimized file <br>
        <br>
        how one can fetch that from the *.edr file <br>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
    Check out g_energy -h. There are flags that allow you to choose a
    subset of the stored values.<br>
    <br>
    I'm deliberately not telling you the answer - learn how to look it
    up and you'll learn other things as well :)<br>
    <br>
    Mark<br>
  </body>
</html>