<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=windows-1256">
<style id="owaParaStyle">P {
        MARGIN-TOP: 0px; MARGIN-BOTTOM: 0px
}
</style>
</head>
<body fPStyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Calibri;color: #000000;font-size: 12pt;">
<div>
<p id="">Dear Gromacs Users,</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>My&nbsp;system&nbsp;has 30 ligands - they aggregate and and seperate during the simulation time and stack to two sites of my protein (two clusters). I want to calculate the interface area between ligands and protein so I need to substract the interface&nbsp;between ligands
 due to the aggregations. Do you know how to do this? </p>
<p>&nbsp;</p>
<p>Thank you in advance!</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>Jan</p>
</div>
</div>
</body>
</html>