Dear users,<br><br>I want to calculate hydrophilic and hyrophobic SASA value of each residue in protein. I used a command as the following:<br><br>g_sas -f run.xtc -s run.tpr -or protein_protein.xvg<br>Select a group for calculation of surface and a group for output<br>
select a group: 1 (protein)<br>select a group: 2 (protein)<br clear="all"><br>But there is SASA value of each residue in the output file. How can I seperate the residues as a hydrophilic and hyrophobic SASA?<br><br>Thanks in advance<br>
-- <br>Ahmet YILDIRIM<br>