<div dir="ltr">


        
        
        
        <style type="text/css">p { margin-bottom: 0.08in; }</style>

<p style="margin-bottom: 0in;">Dear Justin, gmx users,</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">I putted a FF folder to the gromacs
execution directory + changed specbond.dat and it works (I have got
isopeptide bond). 
</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">In old gromacs I needed only to made a
local copy of all gromacs and made changes in FF in its folders and
not to copy FF folder to execution directory (every time to each new
execution directory).</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">Note difference. Maybe I can do somehow
the same for new gromacs. 
</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">Thank you very much for help! You pay a
lot of attention for my requests  as usual.</p>
<br>P.S<br>+ to specbond.dat:<br><b>LYS</b>     NZ      1       <b>GLY</b>     C       1       0.13    LYQ     GLQ<br clear="all"><br>-- <br><div dir="ltr"><p style="margin-bottom: 0in;">Sincerely,</p>
<p style="margin-bottom: 0in;">Yulian Gavrilov 
</p></div><br>
</div>