Hello to all,<br>                   I am using the Gromacs 4.5.3 in 
Centos-5. When I tried to open the<i><b> .xvg</b></i> file by gnuplot it shown the error. I am attaching the gnuplot error and the data of .xvg file. It show that line 9:invalid character. Please help me. <br>
<br>Thanks in advance.<br><b><br>gnuplot error:</b><br><br>gnuplot&gt; load &quot;/home/ujj/Ligand/ligand_nvt_potential.xvg&quot;<br><br>gnuplot&gt; @    title &quot;Gromacs Energies&quot;<br>         ^<br>         &quot;/home/ujj/Ligand/ligand_nvt_potential.xvg&quot;, line 9: invalid character<br>
<b><br><br>.xvg file:</b><br><br># This file was created Fri Jul  8 13:48:25 2011<br># by the following command:<br># /usr/local/gromacs/bin/g_energy -f ligand_nvt.edr -o ligand_nvt_potential.xvg <br>#<br># g_energy is part of G R O M A C S:<br>
#<br># Gromacs Runs One Microsecond At Cannonball Speeds<br>#<br>@    title &quot;Gromacs Energies&quot;<br>@    xaxis  label &quot;Time (ps)&quot;<br>@    yaxis  label &quot;(kJ/mol)&quot;<br>@TYPE xy<br>@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85<br>
@ legend on<br>@ legend box on<br>@ legend loctype view<br>@ legend 0.78, 0.8<br>@ legend length 2<br>@ s0 legend &quot;Potential&quot;<br>    0.000000  -229931.250000<br>    0.200000  -219294.718750<br>    0.400000  -219040.437500<br>
    0.600000  -220054.687500<br>    0.800000  -220712.843750<br>    1.000000  -221827.187500<br>    1.200000  -223225.656250<br>    1.400000  -224130.406250<br>    1.600000  -225367.609375<br>    1.800000  -226086.781250<br>
    2.000000  -226405.015625<br>    2.200000  -227048.406250<br>    2.400000  -228034.328125<br>    2.600000  -229054.906250<br>    2.800000  -229500.281250<br>    3.000000  -230190.187500<br>    3.200000  -231472.281250<br>
    3.400000  -231958.984375<br>    3.600000  -233090.656250<br>    3.800000  -233659.437500<br>    4.000000  -234244.562500<br>    4.200000  -234493.218750<br>    4.400000  -235216.609375<br>    4.600000  -235904.093750<br>
    4.800000  -236398.921875<br>    5.000000  -236869.656250<br>    5.200000  -237497.328125<br>    5.400000  -237401.984375<br>    5.600000  -237872.593750<br>    5.800000  -237578.609375<br>    6.000000  -238344.015625<br>
    6.200000  -239002.625000<br>    6.400000  -238829.187500<br>    6.600000  -238715.328125<br>    6.800000  -239435.687500<br>    7.000000  -239527.125000<br>    7.200000  -238934.468750<br>    7.400000  -238499.796875<br>
    7.600000  -238801.218750<br>    7.800000  -239208.500000<br>    8.000000  -239204.515625<br>    8.200000  -238659.687500<br>    8.400000  -239186.625000<br>    8.600000  -238874.906250<br>    8.800000  -238871.625000<br>
    9.000000  -239048.312500<br>    9.200000  -239218.828125<br>    9.400000  -239035.125000<br>    9.600000  -239023.093750<br>    9.800000  -239736.250000<br>   10.000000  -239027.671875<br>   10.200000  -239188.937500<br>
   10.400000  -239907.750000<br>   10.600000  -239837.406250<br>   10.800000  -238896.828125<br>   11.000000  -239496.437500<br>   11.200000  -239537.968750<br>   11.400000  -239693.062500<br>   11.600000  -239968.156250<br>
   11.800000  -239782.812500<br>   12.000000  -239765.750000<br>   12.200000  -239963.484375<br>   12.400000  -239707.031250<br>   12.600000  -239752.750000<br>   12.800000  -239782.515625<br>   13.000000  -239841.656250<br>
   13.200000  -239684.375000<br>   13.400000  -239682.203125<br>   13.600000  -239919.984375<br>   13.800000  -240316.859375<br>   14.000000  -240810.171875<br>   14.200000  -239970.046875<br>   14.400000  -240075.125000<br>
   14.600000  -240339.968750<br>   14.800000  -239849.234375<br>   15.000000  -240134.812500<br>   15.200000  -240151.625000<br>   15.400000  -240118.906250<br>   15.600000  -240319.250000<br>   15.800000  -239555.234375<br>
   16.000000  -239735.062500<br>   16.200000  -240262.531250<br>   16.400000  -240306.078125<br>   16.600000  -239807.140625<br>   16.800000  -239831.406250<br>   17.000000  -240388.390625<br>   17.200000  -240778.937500<br>
   17.400000  -240516.187500<br>   17.600000  -240856.375000<br>   17.800000  -240970.734375<br>   18.000000  -241115.125000<br>   18.200000  -240833.093750<br>   18.400000  -241239.250000<br>   18.600000  -241271.890625<br>
   18.800000  -240944.406250<br>   19.000000  -240829.750000<br>   19.200000  -241153.890625<br>   19.400000  -241318.406250<br>   19.600000  -240377.468750<br>   19.800000  -241239.609375<br>   20.000000  -241104.718750<br>
   20.200000  -240768.312500<br>   20.400000  -240314.953125<br>   20.600000  -241133.718750<br>   20.800000  -240620.250000<br>   21.000000  -240455.828125<br>   21.200000  -240572.406250<br>   21.400000  -241675.687500<br>
   21.600000  -241080.218750<br>   21.800000  -241602.171875<br>   22.000000  -240867.562500<br>   22.200000  -240573.031250<br>   22.400000  -241143.937500<br>   22.600000  -240699.562500<br>   22.800000  -241138.343750<br>
   23.000000  -241296.187500<br>   23.200000  -241080.171875<br>   23.400000  -240899.062500<br>   23.600000  -240914.281250<br>   23.800000  -241101.546875<br>   24.000000  -241557.531250<br>   24.200000  -241937.468750<br>
   24.400000  -242115.218750<br>   24.600000  -242336.312500<br>   24.800000  -242271.390625<br>   25.000000  -241917.296875<br>   25.200000  -241739.500000<br>   25.400000  -241651.078125<br>   25.600000  -242400.250000<br>
   25.800000  -242341.343750<br>   26.000000  -241441.718750<br>   26.200000  -241050.343750<br>   26.400000  -241589.875000<br>   26.600000  -241205.125000<br>   26.800000  -240567.843750<br>   27.000000  -241302.000000<br>
   27.200000  -240859.453125<br>   27.400000  -241262.500000<br>   27.600000  -242010.906250<br>   27.800000  -241610.031250<br>   28.000000  -241115.656250<br>   28.200000  -241630.859375<br>   28.400000  -242252.765625<br>
   28.600000  -241906.140625<br>   28.800000  -241731.500000<br>   29.000000  -242025.218750<br>   29.200000  -241315.500000<br>   29.400000  -241879.734375<br>   29.600000  -241338.312500<br>   29.800000  -241952.968750<br>
   30.000000  -241981.375000<br>   30.200000  -241912.125000<br>   30.400000  -241606.812500<br>   30.600000  -241400.187500<br>   30.800000  -241521.078125<br>   31.000000  -241569.156250<br>   31.200000  -242319.171875<br>
   31.400000  -240849.000000<br>   31.600000  -240627.859375<br>   31.800000  -240839.656250<br>   32.000000  -241227.250000<br>   32.200000  -241306.328125<br>   32.400000  -240693.265625<br>   32.600000  -241272.250000<br>
   32.800000  -240501.062500<br>   33.000000  -241127.000000<br>   33.200000  -241170.296875<br>   33.400000  -241068.062500<br>   33.600000  -241461.156250<br>   33.800000  -241401.203125<br>   34.000000  -241470.437500<br>
   34.200000  -241869.218750<br>   34.400000  -241940.718750<br>   34.600000  -241882.265625<br>   34.800000  -242695.046875<br>   35.000000  -242192.281250<br>   35.200000  -242197.000000<br>   35.400000  -242515.937500<br>
   35.600000  -242442.937500<br>   35.800000  -242068.484375<br>   36.000000  -242868.984375<br>   36.200000  -241762.843750<br>   36.400000  -241329.656250<br>   36.600000  -241306.828125<br>   36.800000  -241344.421875<br>
   37.000000  -240824.093750<br>   37.200000  -241611.968750<br>   37.400000  -241450.343750<br>   37.600000  -241806.140625<br>   37.800000  -241123.062500<br>   38.000000  -241685.593750<br>   38.200000  -241062.437500<br>
   38.400000  -241920.781250<br>   38.600000  -241849.562500<br>   38.800000  -241933.375000<br>   39.000000  -242288.968750<br>   39.200000  -242630.937500<br>   39.400000  -241874.687500<br>   39.600000  -241398.906250<br>
   39.800000  -242195.312500<br>   40.000000  -241473.843750<br>   40.200000  -241685.250000<br>   40.400000  -241767.218750<br>   40.600000  -241621.562500<br>   40.800000  -242299.468750<br>   41.000000  -241959.140625<br>
   41.200000  -241724.937500<br>   41.400000  -241819.234375<br>   41.600000  -242029.093750<br>   41.800000  -242157.281250<br>   42.000000  -242195.125000<br>   42.200000  -241794.781250<br>   42.400000  -241881.109375<br>
   42.600000  -240992.062500<br>   42.800000  -240941.562500<br>   43.000000  -241822.812500<br>   43.200000  -241962.406250<br>   43.400000  -241471.578125<br>   43.600000  -241928.062500<br>   43.800000  -242123.015625<br>
   44.000000  -241819.062500<br>   44.200000  -242054.203125<br>   44.400000  -241976.375000<br>   44.600000  -241992.843750<br>   44.800000  -242131.250000<br>   45.000000  -242142.359375<br>   45.200000  -242258.312500<br>
   45.400000  -242068.937500<br>   45.600000  -242054.093750<br>   45.800000  -242629.843750<br>   46.000000  -242153.718750<br>   46.200000  -241962.375000<br>   46.400000  -242016.609375<br>   46.600000  -242753.484375<br>
   46.800000  -241986.218750<br>   47.000000  -242060.937500<br>   47.200000  -241954.359375<br>   47.400000  -242234.828125<br>   47.600000  -242000.531250<br>   47.800000  -242127.593750<br>   48.000000  -242390.640625<br>
   48.200000  -242281.640625<br>   48.400000  -242409.093750<br>   48.600000  -242473.593750<br>   48.800000  -242264.515625<br>   49.000000  -242001.546875<br>   49.200000  -241905.593750<br>   49.400000  -241949.171875<br>
   49.600000  -241940.375000<br>   49.800000  -242304.312500<br>   50.000000  -242232.843750<br>   50.200000  -241997.875000<br>   50.400000  -242878.218750<br>   50.600000  -242211.843750<br>   50.800000  -241983.968750<br>
   51.000000  -242191.703125<br>   51.200000  -242416.156250<br>   51.400000  -241977.203125<br>   51.600000  -241751.843750<br>   51.800000  -242096.437500<br>   52.000000  -241737.750000<br>   52.200000  -242195.328125<br>
   52.400000  -242652.500000<br>   52.600000  -242501.375000<br>   52.800000  -242556.906250<br>   53.000000  -242658.625000<br>   53.200000  -242194.687500<br>   53.400000  -242694.687500<br>   53.600000  -241961.625000<br>
   53.800000  -241685.000000<br>   54.000000  -241946.812500<br>   54.200000  -241958.843750<br>   54.400000  -242368.703125<br>   54.600000  -241681.375000<br>   54.800000  -241980.062500<br>   55.000000  -241750.906250<br>
   55.200000  -241694.453125<br>   55.400000  -242184.671875<br>   55.600000  -241385.203125<br>   55.800000  -241520.515625<br>   56.000000  -241253.609375<br>   56.200000  -241195.390625<br>   56.400000  -242256.593750<br>
   56.600000  -241291.109375<br>   56.800000  -241981.156250<br>   57.000000  -242593.312500<br>   57.200000  -242166.750000<br>   57.400000  -242271.656250<br>   57.600000  -241507.015625<br>   57.800000  -242212.812500<br>
   58.000000  -242408.859375<br>   58.200000  -242036.640625<br>   58.400000  -241810.843750<br>   58.600000  -242447.421875<br>   58.800000  -242511.906250<br>   59.000000  -242609.593750<br>   59.200000  -242131.281250<br>
   59.400000  -242081.750000<br>   59.600000  -242165.359375<br>   59.800000  -241743.343750<br>   60.000000  -242383.500000<br>   60.200000  -242848.625000<br>   60.400000  -242039.296875<br>   60.600000  -242128.812500<br>
   60.800000  -242713.140625<br>   61.000000  -241969.484375<br>   61.200000  -242153.187500<br>   61.400000  -242099.828125<br>   61.600000  -242451.609375<br>   61.800000  -242060.265625<br>   62.000000  -242109.328125<br>
   62.200000  -242818.562500<br>   62.400000  -241981.453125<br>   62.600000  -242494.031250<br>   62.800000  -242435.781250<br>   63.000000  -242502.218750<br>   63.200000  -242429.656250<br>   63.400000  -242547.421875<br>
   63.600000  -242306.015625<br>   63.800000  -242689.062500<br>   64.000000  -241948.250000<br>   64.200000  -242695.000000<br>   64.400000  -242306.843750<br>   64.600000  -242118.609375<br>   64.800000  -242068.312500<br>
   65.000000  -242121.734375<br>   65.200000  -242429.609375<br>   65.400000  -242557.546875<br>   65.600000  -243068.343750<br>   65.800000  -242949.500000<br>   66.000000  -242703.156250<br>   66.200000  -243539.859375<br>
   66.400000  -242922.218750<br>   66.600000  -242470.390625<br>   66.800000  -242374.906250<br>   67.000000  -242417.984375<br>   67.200000  -242648.375000<br>   67.400000  -242399.937500<br>   67.600000  -242328.453125<br>
   67.800000  -242173.250000<br>   68.000000  -242679.250000<br>   68.200000  -242667.312500<br>   68.400000  -242085.968750<br>   68.600000  -242262.281250<br>   68.800000  -242342.468750<br>   69.000000  -242433.781250<br>
   69.200000  -242562.343750<br>   69.400000  -241948.093750<br>   69.600000  -242426.375000<br>   69.800000  -242022.328125<br>   70.000000  -242510.250000<br>   70.200000  -242267.359375<br>   70.400000  -242815.859375<br>
   70.600000  -242209.171875<br>   70.800000  -242713.718750<br>   71.000000  -241838.968750<br>   71.200000  -242022.531250<br>   71.400000  -242004.046875<br>   71.600000  -242316.046875<br>   71.800000  -242914.281250<br>
   72.000000  -242054.500000<br>   72.200000  -242510.125000<br>   72.400000  -242377.234375<br>   72.600000  -241608.218750<br>   72.800000  -241846.968750<br>   73.000000  -241604.687500<br>   73.200000  -242027.187500<br>
   73.400000  -242122.812500<br>   73.600000  -241954.750000<br>   73.800000  -242594.312500<br>   74.000000  -242980.531250<br>   74.200000  -241818.375000<br>   74.400000  -242069.625000<br>   74.600000  -242627.453125<br>
   74.800000  -242663.718750<br>   75.000000  -242001.765625<br>   75.200000  -242216.406250<br>   75.400000  -242971.343750<br>   75.600000  -242861.812500<br>   75.800000  -243112.281250<br>   76.000000  -242167.031250<br>
   76.200000  -242498.843750<br>   76.400000  -242055.515625<br>   76.600000  -242282.828125<br>   76.800000  -241850.468750<br>   77.000000  -242015.437500<br>   77.200000  -243013.562500<br>   77.400000  -242811.500000<br>
   77.600000  -242787.375000<br>   77.800000  -242224.968750<br>   78.000000  -242308.125000<br>   78.200000  -242496.609375<br>   78.400000  -242631.875000<br>   78.600000  -242164.140625<br>   78.800000  -241052.718750<br>
   79.000000  -242130.781250<br>   79.200000  -242039.234375<br>   79.400000  -242350.406250<br>   79.600000  -242376.406250<br>   79.800000  -243070.781250<br>   80.000000  -242749.062500<br>   80.200000  -242787.625000<br>
   80.400000  -242735.343750<br>   80.600000  -242450.156250<br>   80.800000  -243008.984375<br>   81.000000  -242816.640625<br>   81.200000  -242853.187500<br>   81.400000  -243181.750000<br>   81.600000  -242260.781250<br>
   81.800000  -242289.718750<br>   82.000000  -242454.671875<br>   82.200000  -242457.312500<br>   82.400000  -242783.484375<br>   82.600000  -242428.218750<br>   82.800000  -242308.234375<br>   83.000000  -241672.906250<br>
   83.200000  -242352.281250<br>   83.400000  -241878.156250<br>   83.600000  -242605.343750<br>   83.800000  -242659.531250<br>   84.000000  -242708.484375<br>   84.200000  -242736.031250<br>   84.400000  -242189.937500<br>
   84.600000  -242717.125000<br>   84.800000  -242913.640625<br>   85.000000  -242669.765625<br>   85.200000  -242401.250000<br>   85.400000  -242348.406250<br>   85.600000  -242784.156250<br>   85.800000  -242745.500000<br>
   86.000000  -242784.656250<br>   86.200000  -243099.718750<br>   86.400000  -242406.406250<br>   86.600000  -242662.343750<br>   86.800000  -242972.187500<br>   87.000000  -242597.468750<br>   87.200000  -243460.312500<br>
   87.400000  -243023.015625<br>   87.600000  -242043.343750<br>   87.800000  -242404.500000<br>   88.000000  -243317.437500<br>   88.200000  -242743.218750<br>   88.400000  -242238.062500<br>   88.600000  -243149.500000<br>
   88.800000  -242657.828125<br>   89.000000  -243042.765625<br>   89.200000  -242832.234375<br>   89.400000  -243271.843750<br>   89.600000  -242982.343750<br>   89.800000  -243330.437500<br>   90.000000  -242721.750000<br>
   90.200000  -242591.250000<br>   90.400000  -242654.218750<br>   90.600000  -242769.531250<br>   90.800000  -242789.515625<br>   91.000000  -242482.546875<br>   91.200000  -243028.453125<br>   91.400000  -242403.093750<br>
   91.600000  -242254.640625<br>   91.800000  -241645.968750<br>   92.000000  -242278.046875<br>   92.200000  -242161.531250<br>   92.400000  -242242.656250<br>   92.600000  -242428.156250<br>   92.800000  -243514.468750<br>
   93.000000  -243319.765625<br>   93.200000  -243183.281250<br>   93.400000  -242671.921875<br>   93.600000  -242763.046875<br>   93.800000  -242586.640625<br>   94.000000  -242565.281250<br>   94.200000  -242145.234375<br>
   94.400000  -242566.500000<br>   94.600000  -242382.468750<br>   94.800000  -242301.437500<br>   95.000000  -242574.390625<br>   95.200000  -242128.531250<br>   95.400000  -241968.015625<br>   95.600000  -242318.781250<br>
   95.800000  -242614.875000<br>   96.000000  -243034.734375<br>   96.200000  -243061.171875<br>   96.400000  -242386.781250<br>   96.600000  -242364.687500<br>   96.800000  -241825.093750<br>   97.000000  -242219.500000<br>
   97.200000  -242616.296875<br>   97.400000  -242946.593750<br>   97.600000  -242282.437500<br>   97.800000  -242090.421875<br>   98.000000  -241557.671875<br>   98.200000  -242052.671875<br>   98.400000  -242357.828125<br>
   98.600000  -242622.953125<br>   98.800000  -242419.546875<br>   99.000000  -242963.156250<br>   99.200000  -242370.125000<br>   99.400000  -242272.656250<br>   99.600000  -242551.593750<br>   99.800000  -242698.000000<br>
  100.000000  -242706.312500<br><br><br clear="all"><br>-- <br>Manoj Kumar Gadhwal (M. Pharma),<br>Research Schloar,<br>Prin. K. M. Kundnani College of Pharmacy,<br>Colaba, Mumbai-05.<br>Cont. No. +91 9769051866<br>